La Sociedad Chilena de Oftalmología está preocupada, según el diario chileno El Mercurio, por la 'Misión Milagro' venezolana, y aclaró que dicho programa, por tener un propósito eminentemente publicitario y político, se opone a todos los esfuerzos públicos y privados por entregar a la población de Chile atenciones oftalmológicas seguras y de alta calidad.
Los oftalmóloos chilenos dice que trasladar a un paciente de un país a otro, sin evaluación previa de su patología y condición general de salud, para ser intervenido junto con otros cientos, en condiciones técnicas y sanitarias desconocidas, siendo posteriormente retornados a su país de origen sin control de sus resultados ni ser sometidos a seguimiento médico durante la convalecencia, no se condice con las iniciativas públicas y privadas implementadas en Chile.
Para los médicos chilenos, todo lo anterior conlleva una serie de riesgos, y agregan que el hecho de que las cirugías sean efectuadas por médicos foráneos no permite una adecuada relación médico-paciente, tal como se merece toda persona que se ve afectada por una enfermedad y con mayor razón aun si esa persona carece de recursos propios para enfrentar el proceso de recuperación de su salud.
Sin embargo, la ministra de Salud chilena, María Soledad Barría, accedió a que se aplicara este proyecto en su país, pese a que las enfermedades de cataratas y pterigión (crecimiento en forma de ala del tejido conjuntivo que se inicia en una esquina del ojo) son cubiertas por el plan Auge.
Además, se llegó a un acuerdo tácito para que no se exagerara la publicidad, pasando por encima de las capacidades de salud de Chile.
Fue el capítulo chileno del Congreso Bolivariano quien buscó a los pacientes.